一、畸形果
有三個類型。一是變形果。這種畸形果的結構沒有很大的變化，但形狀不圓正，有的爲橢圓形果，即由於心皮增加，其橫切面是橢圓形;有的成爲尖嘴果，即桃形果，果實的心皮數是正常的，但果臍部特別突起如桃子形狀。二是瘤狀果。果實近萼片一端有瘤狀凸起，形如鼻，所以叫做鼻狀瘤。三是臍裂果。在果臍部分的果皮裂開，以致胎座組織以及種子有時向外翻卷、裸露。這種臍裂果往往是由於畸形花的花柱開裂造成的。畸形果的造成是在花芽分化時就開始的。花芽分化時低溫，水肥、光照不足，營養不良時，花芽分化不良，易形成少心室的尖頂果等畸形果。花芽分化期如果水肥過多、光照充足、莖葉旺盛，而溫度較低時，花芽分化營養過剩，花芽細胞分裂過旺，則易形成多心皮的橢圓形果或瘤狀果。此外，生長刺激素施用濃度過高，易形成尖頂果;土壤過幹或過溼影響花芽發育，也易形成畸形果。
防止畸形果的產生必須從育苗期開始。苗期注意溫、光、水、肥等環境條件的控制，創造有利於花芽分化的條件，使用生長刺激素適當，即可避免或減少畸形果的發生。
二、粒形果
果實坐住後發育極慢，成熟後形小如櫻粒，此稱粒形果或僵果。在西紅柿越冬栽培和早熟栽培中發生粒形果現象較多。其發生原因是開花期授粉不良、夜溫低、光照不足、營養物積累太少，經過生長刺激素處理後，抑制了果柄處離層的產生，果實坐住後，光合產物供應太少而不能膨大造成的。防止粒形果產生的措施是噴施天然蕓薹素—碩豐481的萬分之一液，開花期改善溫度、光照等環境條件，增強光合作用，改善果實的營養供應等。
三、污斑、褐心
污斑果皮組織中出現黃色或綠色的斑塊。污斑果實的出現與種子的生長密度有關，心室中種子數目少，激素的活性降低，果汁中可溶性固形物含量較低，則易出現污斑。防止污斑產生的措施是加強肥水管理，噴施天然蕓薹素—碩豐481的萬分之一液。褐心：果實的維管束褐變，或果實的內部變爲灰褐色。褐心一般是病毒引起的，也有生理性褐心現象。在光照弱、空氣潮溼及缺少鉀肥的條件下易發生。防止褐心的措施是：注意防治病毒，改善光照條件，適當通風排溼及增施鉀肥。生長期可根外噴施高能紅鉀的0.2%液3-4次。
