同属亚洲的邻国关系。
新加坡曾作为联邦省加入马来西亚，后因各方面的原因而独立出来。新加坡在19世纪初沦为英国殖民地，在1963年9月脱离英国的统治正式加入马来西亚。由于各方面因素，马来西亚国会于1965年8月9日将新加坡驱逐出联邦。隔日新加坡独立建国。
1965年8月9日，新加坡脱离马来西亚，成为一个有主权、民主和独立的国家。同年12月22日，新加坡成为共和国，尤索夫·宾·伊萨克出任首任总统。
新加坡北隔柔佛海峡与马来西亚为邻，南隔新加坡海峡与印度尼西亚相望，毗邻马六甲海峡南口，国土除新加坡岛(占全国面积的88.5%)之外，还包括周围63个小岛。
马来西亚和新加坡在上世纪本是一家人，自从新加坡从马来西亚独立出来以后，在涉及领土主权、生活生产，以及经济利益等方面矛盾逐渐显现，甚至使两国陷入关系恶化的局面。
现在的新加坡是东南亚地区的一个岛国，面积仅有719平方公里，还不如我国一些县的面积大，新加坡离邻国最近的就马来西亚，中间就隔着一条1.4公里长的柔佛海峡。
本来在历史上，新加坡并不是个独立的国家，早在18世纪19世纪时，新加坡就是马来西亚的一部分，那时候的马来西亚领土中有一个叫柔佛王国，新加坡就是柔佛王国的辖地。
所以新加坡和马来西亚也算是“本是同根生”的兄弟了，同在一个屋檐下，两地的人员往来和经商贸易也是非常的密切。此后大英帝国的殖民统治延伸到此地，新加坡被英国“掳走”。然而，二战的来临，新加坡的命运再遭改变。
二战期间，新加坡被日本帝国主义军队占领，在日本投降后，虽然英国恢复了对新加坡的殖民统治，但是没多久，随着全世界民族解放运动兴起，新加坡也于1959年6月实行内部自治，成为自治邦。
由于当时全球贸易往来和服务业并不像如今这么发达，独守孤岛的新加坡生存面临窘境，作为当时新加坡的当家人李光耀不得不提出希望与马来亚共同组建国家，是曰“马来西亚”。果然这个计划获得通过，新加坡再次找到归宿。
令李光耀意料不及的是，新加坡“回归”马来西亚，并未给新加坡带来重大福利，反而惹了一身骚。由于新加坡岛绝大部分人是华人华裔，与马来亚人的冲突矛盾急剧升温。马来亚人作为马来西亚国家的主体族群，自然会处处给马来人自己谋福利，令新加坡华人华裔备感悲愤。
另一方面，新加坡岛还有一个强大的邻居，就是当今世界最大的群岛国家，也是穆斯林人口最多的国家印度尼西亚，印尼的.小算盘当时打的够精的，不愿意身边出现一个强大的邻居，就果断切断与邻国的关系，人员往来停滞，很会做生意的新加坡华人商人由此损失惨重。
李光耀当初想的是依靠马来西亚这棵大树，能好乘凉。可新加坡从1963年9月16日正式并入马来西亚，到1965年8月9日正式宣告脱离马来西亚成立一个独立的共和国，这短短两年的时间，可把新加坡害苦了。
事实证明了，把自己的发展寄希望于别人，到头来等到的永远都是哑巴亏，有苦还说不出。
新加坡从马来西亚独立后，两者作为独立国家，瞬间从一个屋檐下的一家人，开始成为吃两家饭的邻居。也是从这一刻开始，由于主权国家所引起的领土主权归属、利益分割、生产生活等问题也接踵而来，至今新加坡和马来西亚仍有三大主要问题，成为阻碍两国关系的绊脚石。
新加坡对马来西亚供水价格抬高问题
新加坡虽然是个岛国，但是淡水资源极度匮乏，甚至不得不向邻国马来西亚的柔佛州买水喝。在1962年，新加坡还是英国殖民地，并未与马来西亚合并之时，两者就关于向新加坡供水问题达成协议。
当时规定马来西亚柔佛州每天向新加坡供水3.25亿升淡水（32.5万立方米），每1000加仑（相当于4546升）水只收0.03林吉特（相当于5分人民币），也就是说每年新加坡向马来西亚提供水费仅有3574元人民币左右。
这项协议持续到2011年，失效后，新加坡和马来西亚又续签了协议，有效期从2011年到2061年，这份协议中，新加坡向马来西亚买的水量大幅提升，达到9.46亿升淡水，但是水价还是原价没变。
长期低廉的水价，引起新上任的马哈蒂尔首相的不满，在2018年6月26日，马来西亚总理马哈蒂尔接受新加坡媒体时表示：
马来西亚有重新考虑与新加坡之间供水协议的计划，希望提升供水价格。马哈蒂尔直言水价太低，搁现在什么都买不到。确实3000元人民币左右的水价养活新加坡一半人口，确实太低了。
而新加坡也不满马来西亚的提议，认为既已达成协议，便不可违背协议，两国的供水矛盾便由此产生。马来西亚军队高级军官曾表示：如果马新供水问题无法妥善处理，有可能引发两国的军事冲突。
新加坡对马来西亚单方面填海造地问题严重不满
此前，马来西亚修建马六甲皇京港，已经惹得新加坡方面严重不满，认为马来西亚此举意在和新加坡抢生意，削弱新加坡作为国际贸易中转站的地位。现在，马来西亚又要在柔佛州扩建巴鲁港。
马来西亚的巴鲁港与新加坡隔海相望，是马来半岛南部的重要港口之一，2018年10月份正式提出要扩建，由于柔佛州的.巴鲁港可能与新加坡有海堤相连，马来西亚一旦扩建，必然会压缩新加坡在该地的权益，随即新加坡对马来西亚的马哈蒂尔政府提出抗议。
马来西亚的填海造地问题，在某种程度上说也是涉及到新加坡的主权问题，还是比较严重的。
新加坡与马来西亚围绕南海白礁岛主权争夺问题
新加坡和马来西亚为了南海的白礁岛还闹上国际法庭，这个白礁岛距离马来西亚的柔佛州7.7海里，距离新加坡25.5海里，只有2000平方米大，是个无人居住的岛礁。
白礁岛最早的主权是马来西亚柔佛州，但是由于英国殖民主占领该地区后，就把白礁岛交给新加坡管辖，而且从1847年至1979年，在这130年时间内，新加坡对白礁岛的主权声索已经是众所周知
国际并未提任何异议。直到1979年，马来西亚才突然在其所出版的新地图中首次把白礁岛划入马来西亚的领土范围，开始与新加坡争夺白礁岛的主权。
